Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLEQ07864 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLEQ07864 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLEQ07864 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLEQ07864 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLEQ07864 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLEQ07864 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLEQ07864 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLEQ07864 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLEQ07864 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLEQ07864 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLEQ07864 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLEQ07864 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLEQ07864 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLEQ07864 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLEQ07864 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLEQ07864 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLEQ07864 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLEQ07864 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLEQ07864 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLEQ07864 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLEQ07864 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLEQ07864 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLEQ07864 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLEQ07864 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLEQ07864 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLEQ07864 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLEQ07864 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLEQ07864 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLEQ07864 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLEQ07864 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLEQ07864 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLEQ07864 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLEQ07864 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLEQ07864 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLEQ07864 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLEQ07864 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLEQ07864 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLEQ07864 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLEQ07864 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLEQ07864 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLEQ07864 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLEQ07864 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLEQ07864 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLEQ07864 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLEQ07864 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLEQ07864 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLEQ07864 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLEQ07864 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLEQ07864 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLEQ07864 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms