Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms