Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms