Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDSRQ06136 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms