Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms