Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms