Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCZQ05513 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms