Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EMX2Q04743 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMX2Q04743 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms