Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms