Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms