Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms