Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PLOD1Q02809 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PLOD1Q02809 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLOD1Q02809 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLOD1Q02809 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLOD1Q02809 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLOD1Q02809 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLOD1Q02809 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLOD1Q02809 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLOD1Q02809 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms