Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms