Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms