Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms