Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms