Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms