Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
IRX3P78415 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX3P78415 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX3P78415 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX3P78415 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX3P78415 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX3P78415 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX3P78415 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX3P78415 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX3P78415 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX3P78415 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX3P78415 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX3P78415 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX3P78415 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX3P78415 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX3P78415 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX3P78415 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX3P78415 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX3P78415 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX3P78415 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX3P78415 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX3P78415 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX3P78415 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX3P78415 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX3P78415 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX3P78415 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX3P78415 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX3P78415 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX3P78415 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX3P78415 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX3P78415 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX3P78415 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX3P78415 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX3P78415 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX3P78415 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX3P78415 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX3P78415 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX3P78415 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX3P78415 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX3P78415 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX3P78415 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX3P78415 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX3P78415 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX3P78415 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX3P78415 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX3P78415 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX3P78415 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX3P78415 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX3P78415 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX3P78415 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX3P78415 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX3P78415 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX3P78415 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX3P78415 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX3P78415 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX3P78415 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX3P78415 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX3P78415 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX3P78415 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX3P78415 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX3P78415 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX3P78415 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IRX3P78415 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX3P78415 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IRX3P78415 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms