Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX1P78337 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX1P78337 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX1P78337 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX1P78337 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX1P78337 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX1P78337 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX1P78337 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX1P78337 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX1P78337 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX1P78337 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX1P78337 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX1P78337 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX1P78337 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX1P78337 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX1P78337 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX1P78337 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX1P78337 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX1P78337 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX1P78337 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX1P78337 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX1P78337 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX1P78337 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX1P78337 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX1P78337 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX1P78337 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX1P78337 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX1P78337 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX1P78337 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX1P78337 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX1P78337 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX1P78337 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PITX1P78337 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PITX1P78337 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX1P78337 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX1P78337 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX1P78337 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX1P78337 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX1P78337 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX1P78337 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX1P78337 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX1P78337 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX1P78337 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX1P78337 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX1P78337 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX1P78337 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX1P78337 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX1P78337 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX1P78337 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX1P78337 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX1P78337 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX1P78337 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX1P78337 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX1P78337 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX1P78337 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX1P78337 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX1P78337 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX1P78337 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX1P78337 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX1P78337 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX1P78337 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX1P78337 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX1P78337 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX1P78337 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms