Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTA1P68133 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms