Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTC1P68032 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTC1P68032 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms