Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms