Protein–RNA interactions for Protein: P63010

AP2B1, AP-2 complex subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2B1P63010 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP2B1P63010 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP2B1P63010 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms