Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms