Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMC6P62333 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMC6P62333 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMC6P62333 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMC6P62333 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMC6P62333 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMC6P62333 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMC6P62333 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMC6P62333 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMC6P62333 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMC6P62333 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms