Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms