Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms