Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S2P59780 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms