Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP107P57740 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP107P57740 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP107P57740 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP107P57740 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP107P57740 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP107P57740 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP107P57740 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP107P57740 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP107P57740 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP107P57740 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP107P57740 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP107P57740 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP107P57740 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP107P57740 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP107P57740 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP107P57740 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP107P57740 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP107P57740 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP107P57740 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP107P57740 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP107P57740 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP107P57740 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP107P57740 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP107P57740 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP107P57740 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms