Protein–RNA interactions for Protein: P57087

JAM2, Junctional adhesion molecule B, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM2P57087 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
JAM2P57087 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
JAM2P57087 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAM2P57087 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAM2P57087 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAM2P57087 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAM2P57087 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAM2P57087 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAM2P57087 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAM2P57087 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAM2P57087 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAM2P57087 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAM2P57087 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAM2P57087 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAM2P57087 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAM2P57087 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAM2P57087 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAM2P57087 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAM2P57087 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAM2P57087 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAM2P57087 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAM2P57087 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAM2P57087 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAM2P57087 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAM2P57087 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAM2P57087 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAM2P57087 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAM2P57087 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAM2P57087 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAM2P57087 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAM2P57087 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAM2P57087 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAM2P57087 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAM2P57087 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM2P57087 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM2P57087 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM2P57087 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM2P57087 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM2P57087 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM2P57087 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM2P57087 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM2P57087 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM2P57087 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM2P57087 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM2P57087 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM2P57087 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM2P57087 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM2P57087 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
JAM2P57087 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
JAM2P57087 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAM2P57087 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAM2P57087 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAM2P57087 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAM2P57087 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAM2P57087 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAM2P57087 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAM2P57087 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAM2P57087 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAM2P57087 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAM2P57087 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAM2P57087 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM2P57087 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM2P57087 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM2P57087 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM2P57087 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM2P57087 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM2P57087 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM2P57087 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM2P57087 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM2P57087 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM2P57087 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM2P57087 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM2P57087 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM2P57087 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM2P57087 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM2P57087 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
JAM2P57087 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JAM2P57087 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JAM2P57087 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
JAM2P57087 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
JAM2P57087 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
JAM2P57087 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JAM2P57087 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM2P57087 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM2P57087 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM2P57087 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM2P57087 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM2P57087 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM2P57087 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM2P57087 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM2P57087 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM2P57087 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM2P57087 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM2P57087 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM2P57087 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM2P57087 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM2P57087 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM2P57087 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM2P57087 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM2P57087 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms