Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
AFDNP55196 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFDNP55196 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
AFDNP55196 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFDNP55196 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFDNP55196 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFDNP55196 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFDNP55196 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFDNP55196 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFDNP55196 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFDNP55196 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFDNP55196 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFDNP55196 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFDNP55196 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFDNP55196 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFDNP55196 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFDNP55196 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFDNP55196 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFDNP55196 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFDNP55196 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFDNP55196 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFDNP55196 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFDNP55196 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFDNP55196 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFDNP55196 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFDNP55196 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFDNP55196 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFDNP55196 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFDNP55196 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFDNP55196 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFDNP55196 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AFDNP55196 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AFDNP55196 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AFDNP55196 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AFDNP55196 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AFDNP55196 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AFDNP55196 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
AFDNP55196 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
AFDNP55196 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AFDNP55196 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AFDNP55196 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
AFDNP55196 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFDNP55196 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFDNP55196 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFDNP55196 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFDNP55196 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFDNP55196 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFDNP55196 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFDNP55196 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFDNP55196 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFDNP55196 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFDNP55196 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFDNP55196 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFDNP55196 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFDNP55196 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFDNP55196 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFDNP55196 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
AFDNP55196 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFDNP55196 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFDNP55196 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFDNP55196 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFDNP55196 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFDNP55196 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFDNP55196 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFDNP55196 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFDNP55196 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFDNP55196 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFDNP55196 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFDNP55196 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFDNP55196 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFDNP55196 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFDNP55196 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFDNP55196 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFDNP55196 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFDNP55196 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
AFDNP55196 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFDNP55196 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
AFDNP55196 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFDNP55196 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFDNP55196 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFDNP55196 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFDNP55196 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFDNP55196 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
AFDNP55196 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFDNP55196 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFDNP55196 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFDNP55196 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AFDNP55196 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AFDNP55196 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AFDNP55196 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AFDNP55196 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AFDNP55196 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms