Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF10P55107 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF10P55107 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF10P55107 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF10P55107 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF10P55107 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF10P55107 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF10P55107 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF10P55107 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF10P55107 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF10P55107 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF10P55107 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF10P55107 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF10P55107 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF10P55107 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF10P55107 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF10P55107 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF10P55107 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF10P55107 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF10P55107 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF10P55107 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF10P55107 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF10P55107 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF10P55107 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF10P55107 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF10P55107 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF10P55107 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF10P55107 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF10P55107 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF10P55107 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF10P55107 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF10P55107 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF10P55107 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF10P55107 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF10P55107 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF10P55107 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF10P55107 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF10P55107 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF10P55107 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF10P55107 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF10P55107 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF10P55107 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF10P55107 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF10P55107 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF10P55107 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF10P55107 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF10P55107 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF10P55107 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF10P55107 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF10P55107 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF10P55107 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF10P55107 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF10P55107 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF10P55107 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF10P55107 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF10P55107 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF10P55107 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF10P55107 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF10P55107 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF10P55107 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF10P55107 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF10P55107 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF10P55107 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF10P55107 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF10P55107 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF10P55107 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF10P55107 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF10P55107 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF10P55107 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF10P55107 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF10P55107 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF10P55107 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF10P55107 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF10P55107 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF10P55107 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF10P55107 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF10P55107 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms