Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AIF1P55008 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AIF1P55008 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AIF1P55008 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AIF1P55008 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AIF1P55008 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AIF1P55008 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AIF1P55008 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AIF1P55008 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AIF1P55008 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AIF1P55008 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AIF1P55008 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AIF1P55008 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AIF1P55008 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AIF1P55008 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AIF1P55008 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AIF1P55008 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AIF1P55008 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AIF1P55008 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AIF1P55008 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AIF1P55008 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AIF1P55008 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AIF1P55008 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AIF1P55008 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AIF1P55008 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
AIF1P55008 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AIF1P55008 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AIF1P55008 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AIF1P55008 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AIF1P55008 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AIF1P55008 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AIF1P55008 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AIF1P55008 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AIF1P55008 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AIF1P55008 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AIF1P55008 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AIF1P55008 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AIF1P55008 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AIF1P55008 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AIF1P55008 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AIF1P55008 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AIF1P55008 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AIF1P55008 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AIF1P55008 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AIF1P55008 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AIF1P55008 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AIF1P55008 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AIF1P55008 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AIF1P55008 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AIF1P55008 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AIF1P55008 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AIF1P55008 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AIF1P55008 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AIF1P55008 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AIF1P55008 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AIF1P55008 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AIF1P55008 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AIF1P55008 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AIF1P55008 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AIF1P55008 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AIF1P55008 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AIF1P55008 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AIF1P55008 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AIF1P55008 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AIF1P55008 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AIF1P55008 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AIF1P55008 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AIF1P55008 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AIF1P55008 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AIF1P55008 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AIF1P55008 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AIF1P55008 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AIF1P55008 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AIF1P55008 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AIF1P55008 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AIF1P55008 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AIF1P55008 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AIF1P55008 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AIF1P55008 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AIF1P55008 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIF1P55008 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms