Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P54278 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P54278 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P54278 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P54278 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P54278 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P54278 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P54278 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P54278 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P54278 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P54278 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P54278 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P54278 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P54278 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P54278 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P54278 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P54278 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P54278 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P54278 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P54278 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P54278 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P54278 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P54278 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P54278 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P54278 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P54278 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P54278 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P54278 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P54278 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P54278 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P54278 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P54278 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P54278 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P54278 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P54278 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P54278 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P54278 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P54278 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P54278 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P54278 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P54278 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P54278 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P54278 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P54278 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PMS2P54278 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PMS2P54278 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS2P54278 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS2P54278 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS2P54278 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS2P54278 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS2P54278 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS2P54278 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS2P54278 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS2P54278 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS2P54278 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS2P54278 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P54278 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P54278 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P54278 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P54278 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P54278 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P54278 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P54278 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P54278 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P54278 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P54278 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P54278 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P54278 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P54278 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P54278 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P54278 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P54278 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P54278 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P54278 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P54278 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P54278 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P54278 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P54278 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P54278 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P54278 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms