Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms