Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms