Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCN3P51790 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCN3P51790 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCN3P51790 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN3P51790 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN3P51790 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN3P51790 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN3P51790 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN3P51790 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN3P51790 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN3P51790 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN3P51790 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN3P51790 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN3P51790 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLCN3P51790 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms