Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCNN1GP51170 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms