Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTCFP49711 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CTCFP49711 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTCFP49711 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTCFP49711 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTCFP49711 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTCFP49711 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTCFP49711 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTCFP49711 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTCFP49711 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTCFP49711 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTCFP49711 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTCFP49711 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTCFP49711 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTCFP49711 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTCFP49711 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTCFP49711 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTCFP49711 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTCFP49711 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTCFP49711 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTCFP49711 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTCFP49711 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTCFP49711 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTCFP49711 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTCFP49711 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTCFP49711 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTCFP49711 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTCFP49711 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTCFP49711 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTCFP49711 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTCFP49711 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTCFP49711 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTCFP49711 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTCFP49711 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTCFP49711 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTCFP49711 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTCFP49711 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTCFP49711 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTCFP49711 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CTCFP49711 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTCFP49711 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTCFP49711 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTCFP49711 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTCFP49711 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTCFP49711 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CTCFP49711 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTCFP49711 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTCFP49711 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTCFP49711 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTCFP49711 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTCFP49711 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTCFP49711 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTCFP49711 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTCFP49711 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTCFP49711 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTCFP49711 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTCFP49711 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTCFP49711 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTCFP49711 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTCFP49711 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CTCFP49711 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTCFP49711 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTCFP49711 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTCFP49711 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTCFP49711 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTCFP49711 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CTCFP49711 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CTCFP49711 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTCFP49711 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTCFP49711 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTCFP49711 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTCFP49711 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTCFP49711 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTCFP49711 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTCFP49711 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTCFP49711 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTCFP49711 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTCFP49711 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTCFP49711 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTCFP49711 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTCFP49711 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTCFP49711 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFP49711 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFP49711 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFP49711 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFP49711 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFP49711 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFP49711 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFP49711 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFP49711 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFP49711 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFP49711 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFP49711 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFP49711 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFP49711 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFP49711 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFP49711 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFP49711 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFP49711 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFP49711 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms