Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms