Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTX2P47972 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms