Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL27AP46776 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms