Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RANGAP1P46060 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms