Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETV4P43268 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ETV4P43268 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETV4P43268 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETV4P43268 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ETV4P43268 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ETV4P43268 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ETV4P43268 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETV4P43268 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETV4P43268 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETV4P43268 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ETV4P43268 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETV4P43268 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ETV4P43268 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ETV4P43268 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETV4P43268 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ETV4P43268 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ETV4P43268 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ETV4P43268 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ETV4P43268 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV4P43268 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV4P43268 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV4P43268 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV4P43268 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV4P43268 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV4P43268 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV4P43268 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV4P43268 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV4P43268 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV4P43268 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV4P43268 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV4P43268 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV4P43268 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV4P43268 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV4P43268 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV4P43268 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV4P43268 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV4P43268 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV4P43268 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV4P43268 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV4P43268 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV4P43268 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV4P43268 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV4P43268 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV4P43268 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV4P43268 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV4P43268 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV4P43268 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV4P43268 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV4P43268 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV4P43268 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV4P43268 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV4P43268 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV4P43268 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV4P43268 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV4P43268 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV4P43268 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV4P43268 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV4P43268 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV4P43268 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV4P43268 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV4P43268 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV4P43268 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV4P43268 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV4P43268 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV4P43268 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV4P43268 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV4P43268 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV4P43268 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV4P43268 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV4P43268 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV4P43268 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV4P43268 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV4P43268 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV4P43268 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV4P43268 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV4P43268 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV4P43268 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV4P43268 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV4P43268 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV4P43268 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms