Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THPOP40225 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THPOP40225 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THPOP40225 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THPOP40225 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THPOP40225 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THPOP40225 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THPOP40225 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THPOP40225 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THPOP40225 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THPOP40225 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
THPOP40225 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THPOP40225 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THPOP40225 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THPOP40225 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THPOP40225 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THPOP40225 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THPOP40225 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THPOP40225 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THPOP40225 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THPOP40225 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THPOP40225 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THPOP40225 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
THPOP40225 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THPOP40225 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THPOP40225 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THPOP40225 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THPOP40225 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
THPOP40225 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THPOP40225 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THPOP40225 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THPOP40225 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THPOP40225 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THPOP40225 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
THPOP40225 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
THPOP40225 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THPOP40225 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THPOP40225 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THPOP40225 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THPOP40225 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THPOP40225 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THPOP40225 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THPOP40225 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THPOP40225 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
THPOP40225 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THPOP40225 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THPOP40225 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THPOP40225 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THPOP40225 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
THPOP40225 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
THPOP40225 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THPOP40225 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THPOP40225 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THPOP40225 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THPOP40225 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THPOP40225 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THPOP40225 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THPOP40225 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THPOP40225 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THPOP40225 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THPOP40225 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
THPOP40225 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
THPOP40225 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THPOP40225 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THPOP40225 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THPOP40225 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THPOP40225 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THPOP40225 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THPOP40225 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THPOP40225 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THPOP40225 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THPOP40225 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THPOP40225 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THPOP40225 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THPOP40225 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THPOP40225 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THPOP40225 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THPOP40225 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THPOP40225 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THPOP40225 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THPOP40225 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THPOP40225 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THPOP40225 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THPOP40225 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
THPOP40225 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THPOP40225 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
THPOP40225 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
THPOP40225 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THPOP40225 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THPOP40225 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
THPOP40225 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THPOP40225 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THPOP40225 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THPOP40225 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THPOP40225 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THPOP40225 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THPOP40225 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THPOP40225 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THPOP40225 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THPOP40225 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms