Protein–RNA interactions for Protein: P38351

PAF1, RNA polymerase II-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PAF1P38351 PDR5YOR153W 4536 nt4.91□□□□□ -1.62
PAF1P38351 TRX3YCR083W 384 nt4.9□□□□□ -1.63
PAF1P38351 RPC11YDR045C 333 nt4.9□□□□□ -1.63
PAF1P38351 HIM1YDR317W 1245 nt4.9□□□□□ -1.63
PAF1P38351 AUR1YKL004W 1206 nt4.9□□□□□ -1.63
PAF1P38351 GSP1YLR293C 660 nt4.9□□□□□ -1.63
PAF1P38351 ICS2YBR157C 768 nt4.9□□□□□ -1.63
PAF1P38351 YBR292CYBR292C 372 nt4.9□□□□□ -1.63
PAF1P38351 MDM30YLR368W 1797 nt4.9□□□□□ -1.63
PAF1P38351 TRM12YML005W 1389 nt4.9□□□□□ -1.63
PAF1P38351 VAC17YCL063W 1272 nt4.89□□□□□ -1.63
PAF1P38351 HTD2YHR067W 843 nt4.89□□□□□ -1.63
PAF1P38351 COX3Q0275 810 nt4.89□□□□□ -1.63
PAF1P38351 YAL064WYAL064W 285 nt4.89□□□□□ -1.63
PAF1P38351 IRC25YLR021W 540 nt4.89□□□□□ -1.63
PAF1P38351 YLR365WYLR365W 333 nt4.89□□□□□ -1.63
PAF1P38351 YLR366WYLR366W 306 nt4.89□□□□□ -1.63
PAF1P38351 YBL062WYBL062W 381 nt4.89□□□□□ -1.63
PAF1P38351 IRC13YOR235W 315 nt4.89□□□□□ -1.63
PAF1P38351 YBR137WYBR137W 540 nt4.89□□□□□ -1.63
PAF1P38351 DBP3YGL078C 1572 nt4.89□□□□□ -1.63
PAF1P38351 VPS27YNR006W 1869 nt4.88□□□□□ -1.63
PAF1P38351 SPT15YER148W 723 nt4.88□□□□□ -1.63
PAF1P38351 SRB5YGR104C 924 nt4.88□□□□□ -1.63
PAF1P38351 SEC28YIL076W 891 nt4.88□□□□□ -1.63
PAF1P38351 REE1YJL217W 597 nt4.88□□□□□ -1.63
PAF1P38351 POL32YJR043C 1053 nt4.88□□□□□ -1.63
PAF1P38351 RPL22AYLR061W 366 nt4.88□□□□□ -1.63
PAF1P38351 MOH1YBL049W 417 nt4.88□□□□□ -1.63
PAF1P38351 RPS11BYBR048W 471 nt4.88□□□□□ -1.63
PAF1P38351 NCE102YPR149W 522 nt4.88□□□□□ -1.63
PAF1P38351 HPA2YPR193C 471 nt4.88□□□□□ -1.63
PAF1P38351 YLR152CYLR152C 1731 nt4.88□□□□□ -1.63
PAF1P38351 GSC2YGR032W 5688 nt4.88□□□□□ -1.63
PAF1P38351 ACA1YER045C 1470 nt4.88□□□□□ -1.63
PAF1P38351 UBP6YFR010W 1500 nt4.87□□□□□ -1.63
PAF1P38351 MLH2YLR035C 2088 nt4.87□□□□□ -1.63
PAF1P38351 ROK1YGL171W 1695 nt4.87□□□□□ -1.63
PAF1P38351 RNR1YER070W 2667 nt4.87□□□□□ -1.63
PAF1P38351 RRP17YDR412W 708 nt4.87□□□□□ -1.63
PAF1P38351 SPO73YER046W 432 nt4.87□□□□□ -1.63
PAF1P38351 PRP18YGR006W 756 nt4.87□□□□□ -1.63
PAF1P38351 BOS1YLR078C 735 nt4.87□□□□□ -1.63
PAF1P38351 RPC34YNR003C 954 nt4.87□□□□□ -1.63
PAF1P38351 UFE1YOR075W 1041 nt4.87□□□□□ -1.63
PAF1P38351 SYC1YOR179C 567 nt4.87□□□□□ -1.63
PAF1P38351 HUT1YPL244C 1020 nt4.87□□□□□ -1.63
PAF1P38351 APA1YCL050C 966 nt4.87□□□□□ -1.63
PAF1P38351 SLS1YLR139C 1932 nt4.87□□□□□ -1.63
PAF1P38351 PUB1YNL016W 1362 nt4.87□□□□□ -1.63
PAF1P38351 YTM1YOR272W 1383 nt4.87□□□□□ -1.63
PAF1P38351 AKR1YDR264C 2295 nt4.86□□□□□ -1.63
PAF1P38351 RAD55YDR076W 1221 nt4.86□□□□□ -1.63
PAF1P38351 GEP7YGL057C 864 nt4.86□□□□□ -1.63
PAF1P38351 PEX14YGL153W 1026 nt4.86□□□□□ -1.63
PAF1P38351 MTR2YKL186C 555 nt4.86□□□□□ -1.63
PAF1P38351 YOR263CYOR263C 408 nt4.86□□□□□ -1.63
PAF1P38351 PLM2YDR501W 1566 nt4.86□□□□□ -1.63
PAF1P38351 PMT6YGR199W 2280 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 CHD1YER164W 4407 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 NOP6YDL213C 678 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 YDR193WYDR193W 399 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 PAU10YDR542W 363 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 PAU11YGL261C 363 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 PAU13YHL046C 363 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 CUP1-1YHR053C 186 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 CUP1-2YHR055C 186 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 YPT35YHR105W 645 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 PAU4YLR461W 363 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 YPT7YML001W 627 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 YNL035CYNL035C 1170 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 YNR071CYNR071C 1029 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 REX4YOL080C 870 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 BTS1YPL069C 1008 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 CET1YPL228W 1650 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 RPO31YOR116C 4383 nt4.85□□□□□ -1.63
PAF1P38351 YOS1YER074W-A 258 nt4.84□□□□□ -1.63
PAF1P38351 DCV1YFR012W 609 nt4.84□□□□□ -1.63
PAF1P38351 YGL218WYGL218W 651 nt4.84□□□□□ -1.63
PAF1P38351 IRC9YJL142C 393 nt4.84□□□□□ -1.63
PAF1P38351 ECM4YKR076W 1113 nt4.84□□□□□ -1.63
PAF1P38351 RFC3YNL290W 1023 nt4.84□□□□□ -1.63
PAF1P38351 CCL1YPR025C 1182 nt4.84□□□□□ -1.63
PAF1P38351 RSC1YGR056W 2787 nt4.83□□□□□ -1.64
PAF1P38351 MNL1YHR204W 2391 nt4.83□□□□□ -1.64
PAF1P38351 NHP10YDL002C 612 nt4.83□□□□□ -1.64
PAF1P38351 ERG25YGR060W 930 nt4.83□□□□□ -1.64
PAF1P38351 GPN3YLR243W 819 nt4.83□□□□□ -1.64
PAF1P38351 DUG3YNL191W 1074 nt4.83□□□□□ -1.64
PAF1P38351 PFK27YOL136C 1194 nt4.83□□□□□ -1.64
PAF1P38351 YOR062CYOR062C 807 nt4.83□□□□□ -1.64
PAF1P38351 OM14YBR230C 405 nt4.83□□□□□ -1.64
PAF1P38351 TPD3YAL016W 1908 nt4.83□□□□□ -1.64
PAF1P38351 AEP3YPL005W 1821 nt4.83□□□□□ -1.64
PAF1P38351 ALO1YML086C 1581 nt4.82□□□□□ -1.64
PAF1P38351 ECM16YMR128W 3804 nt4.82□□□□□ -1.64
PAF1P38351 BUD27YFL023W 2391 nt4.82□□□□□ -1.64
PAF1P38351 SNU23YDL098C 585 nt4.82□□□□□ -1.64
PAF1P38351 SEC53YFL045C 765 nt4.82□□□□□ -1.64
PAF1P38351 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.5 ms