Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGP37231 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGP37231 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGP37231 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGP37231 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGP37231 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGP37231 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGP37231 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGP37231 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGP37231 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGP37231 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGP37231 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGP37231 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGP37231 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGP37231 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGP37231 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGP37231 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGP37231 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGP37231 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGP37231 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGP37231 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGP37231 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGP37231 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGP37231 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGP37231 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGP37231 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGP37231 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGP37231 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGP37231 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGP37231 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGP37231 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGP37231 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGP37231 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGP37231 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGP37231 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGP37231 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGP37231 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGP37231 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGP37231 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGP37231 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGP37231 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGP37231 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGP37231 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGP37231 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGP37231 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGP37231 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGP37231 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGP37231 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGP37231 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPARGP37231 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPARGP37231 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGP37231 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGP37231 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGP37231 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGP37231 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGP37231 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGP37231 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGP37231 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGP37231 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGP37231 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGP37231 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGP37231 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGP37231 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGP37231 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGP37231 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGP37231 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGP37231 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGP37231 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGP37231 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGP37231 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGP37231 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms