Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SREBF1P36956 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms