Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBRP36941 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBRP36941 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBRP36941 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBRP36941 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBRP36941 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBRP36941 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBRP36941 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBRP36941 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBRP36941 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBRP36941 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBRP36941 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBRP36941 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBRP36941 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBRP36941 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBRP36941 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBRP36941 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBRP36941 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBRP36941 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBRP36941 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBRP36941 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBRP36941 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBRP36941 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBRP36941 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBRP36941 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBRP36941 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBRP36941 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBRP36941 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBRP36941 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBRP36941 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBRP36941 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBRP36941 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBRP36941 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBRP36941 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBRP36941 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBRP36941 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBRP36941 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBRP36941 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBRP36941 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBRP36941 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBRP36941 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBRP36941 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBRP36941 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBRP36941 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBRP36941 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBRP36941 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBRP36941 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBRP36941 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBRP36941 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBRP36941 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBRP36941 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBRP36941 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBRP36941 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBRP36941 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBRP36941 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBRP36941 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBRP36941 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBRP36941 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBRP36941 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBRP36941 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBRP36941 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBRP36941 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBRP36941 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBRP36941 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBRP36941 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBRP36941 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBRP36941 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBRP36941 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBRP36941 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBRP36941 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBRP36941 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBRP36941 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBRP36941 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBRP36941 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBRP36941 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBRP36941 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBRP36941 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBRP36941 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBRP36941 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBRP36941 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBRP36941 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBRP36941 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBRP36941 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBRP36941 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms