Protein–RNA interactions for Protein: P36068

SHE2, SWI5-dependent HO expression protein 2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHE2P36068 SAS5YOR213C 747 nt2.79□□□□□ -1.96
SHE2P36068 TAF3YPL011C 1062 nt2.79□□□□□ -1.96
SHE2P36068 NIP7YPL211W 546 nt2.79□□□□□ -1.96
SHE2P36068 SHE3YBR130C 1278 nt2.79□□□□□ -1.96
SHE2P36068 VPS17YOR132W 1656 nt2.79□□□□□ -1.96
SHE2P36068 PRR2YDL214C 2100 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 BPT1YLL015W 4680 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 YVH1YIR026C 1095 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 SFH1YLR321C 1281 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 PEX12YMR026C 1200 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 SSO2YMR183C 888 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 PSF3YOL146W 585 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 IMH1YLR309C 2736 nt2.78□□□□□ -1.96
SHE2P36068 AKR1YDR264C 2295 nt2.77□□□□□ -1.97
SHE2P36068 SPB4YFL002C 1821 nt2.77□□□□□ -1.97
SHE2P36068 BCS1YDR375C 1371 nt2.77□□□□□ -1.97
SHE2P36068 FBP26YJL155C 1359 nt2.77□□□□□ -1.97
SHE2P36068 MRT4YKL009W 711 nt2.77□□□□□ -1.97
SHE2P36068 YKR075CYKR075C 924 nt2.77□□□□□ -1.97
SHE2P36068 ERP1YAR002C-A 660 nt2.77□□□□□ -1.97
SHE2P36068 AHP1YLR109W 531 nt2.77□□□□□ -1.97
SHE2P36068 MRPL51YPR100W 423 nt2.77□□□□□ -1.97
SHE2P36068 STP2YHR006W 1626 nt2.77□□□□□ -1.97
SHE2P36068 ITC1YGL133W 3795 nt2.77□□□□□ -1.97
SHE2P36068 MIG1YGL035C 1515 nt2.77□□□□□ -1.97
SHE2P36068 CDH1YGL003C 1701 nt2.76□□□□□ -1.97
SHE2P36068 PUS9YDL036C 1389 nt2.76□□□□□ -1.97
SHE2P36068 NFI1YOR156C 2181 nt2.76□□□□□ -1.97
SHE2P36068 CHK1YBR274W 1584 nt2.76□□□□□ -1.97
SHE2P36068 UBP5YER144C 2418 nt2.76□□□□□ -1.97
SHE2P36068 SNL1YIL016W 480 nt2.76□□□□□ -1.97
SHE2P36068 SDH3YKL141W 597 nt2.76□□□□□ -1.97
SHE2P36068 OCA2YNL056W 594 nt2.76□□□□□ -1.97
SHE2P36068 TMC1YOR052C 453 nt2.76□□□□□ -1.97
SHE2P36068 NOP4YPL043W 2058 nt2.76□□□□□ -1.97
SHE2P36068 PRS5YOL061W 1491 nt2.76□□□□□ -1.97
SHE2P36068 GCD6YDR211W 2139 nt2.75□□□□□ -1.97
SHE2P36068 PMR1YGL167C 2853 nt2.75□□□□□ -1.97
SHE2P36068 LCB4YOR171C 1875 nt2.75□□□□□ -1.97
SHE2P36068 UBP14YBR058C 2346 nt2.75□□□□□ -1.97
SHE2P36068 YCL068CYCL068C 783 nt2.75□□□□□ -1.97
SHE2P36068 PHO92YDR374C 921 nt2.75□□□□□ -1.97
SHE2P36068 PXR1YGR280C 816 nt2.75□□□□□ -1.97
SHE2P36068 DAL2YIR029W 1032 nt2.75□□□□□ -1.97
SHE2P36068 YKL091CYKL091C 933 nt2.75□□□□□ -1.97
SHE2P36068 EMG1YLR186W 759 nt2.75□□□□□ -1.97
SHE2P36068 YLR326WYLR326W 723 nt2.75□□□□□ -1.97
SHE2P36068 SIL1YOL031C 1266 nt2.75□□□□□ -1.97
SHE2P36068 DIM1YPL266W 957 nt2.75□□□□□ -1.97
SHE2P36068 CNS1YBR155W 1158 nt2.75□□□□□ -1.97
SHE2P36068 BCH1YMR237W 2175 nt2.75□□□□□ -1.97
SHE2P36068 HER2YMR293C 1395 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 YDR089WYDR089W 2610 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 RPA190YOR341W 4995 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 RIF1YBR275C 5751 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 ROM1YGR070W 3468 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 MIX14YDR031W 366 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 DYN2YDR424C 279 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 YMR141CYMR141C 309 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 IMP1YMR150C 573 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 IMP4YNL075W 873 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 BUD21YOR078W 645 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 DGA1YOR245C 1257 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 YOR342CYOR342C 960 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 COA2YPL189C-A 207 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 EMP70YLR083C 2004 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 PRP8YHR165C 7242 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 MIC60YKR016W 1623 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 YGR117CYGR117C 1431 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 EPO1YMR124W 2832 nt2.74□□□□□ -1.97
SHE2P36068 STE6YKL209C 3873 nt2.73□□□□□ -1.97
SHE2P36068 RTK1YDL025C 1863 nt2.73□□□□□ -1.97
SHE2P36068 PRM15YMR278W 1869 nt2.73□□□□□ -1.97
SHE2P36068 FRQ1YDR373W 573 nt2.73□□□□□ -1.97
SHE2P36068 YDR442WYDR442W 393 nt2.73□□□□□ -1.97
SHE2P36068 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.73□□□□□ -1.97
SHE2P36068 GTF1YGR102C 552 nt2.73□□□□□ -1.97
SHE2P36068 ARD1YHR013C 717 nt2.73□□□□□ -1.97
SHE2P36068 RPS21BYJL136C 264 nt2.73□□□□□ -1.97
SHE2P36068 ATP12YJL180C 978 nt2.73□□□□□ -1.97
SHE2P36068 SPC3YLR066W 555 nt2.73□□□□□ -1.97
SHE2P36068 DDI3YNL335W 678 nt2.73□□□□□ -1.97
SHE2P36068 YOR314WYOR314W 330 nt2.73□□□□□ -1.97
SHE2P36068 YPL107WYPL107W 747 nt2.73□□□□□ -1.97
SHE2P36068 YBR053CYBR053C 1077 nt2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.9 ms